用pytho寫的分割pdb文件一個腳本

ydn7 9年前發布 | 1K 次閱讀 Python

import glob
def file_list():
    files=[]
    for file in glob.glob("*.pdb"):
        files.append(file)
    files=sorted(files,key=lambda x: int(x[:-4]))
    return files
def split_pdb(pdb_file,files_list,label1,label2):
    f_pdb=open(pdb_file,"r")
    lines=f_pdb.readlines()
    i=0;
    for line in lines:
        if i==12:
            break
        f_store=open(files_list[i],"a+")
        if label1 in line.strip():
            i+=1
            f_store.write(line)
            print "I am here"
            f_store.close()
            continue
        elif line.strip()==label2:
            continue
        else:
            f_store.write(line)
if __name__=="__main__":
    file_lists=file_list()
    split_pdb("hex6-dna.pdb1",file_lists,"TER","ENDMDL")

 本文由用戶 ydn7 自行上傳分享,僅供網友學習交流。所有權歸原作者,若您的權利被侵害,請聯系管理員。
 轉載本站原創文章,請注明出處,并保留原始鏈接、圖片水印。
 本站是一個以用戶分享為主的開源技術平臺,歡迎各類分享!