Python 內存優化
實際項目中,pythoner更加關注的是Python的性能問題,之前也寫過一篇文章《 Python性能優化 》介紹Python性能優化的一些方法。而本文,關注的是Python的內存優化,一般說來,如果不發生內存泄露,運行在服務端的Python代碼不用太關心內存,但是如果運行在客戶端(比如移動平臺上),那還是有優化的必要。具體而言,本文主要針對的Cpython,而且不涉及C擴展。
我們知道,Python使用引用技術和垃圾回收來管理內存,底層也有各種類型的內存池,那我們怎么得知一段代碼使用的內存情況呢?工欲善其事必先利其器,直接看windows下的任務管理器或者linux下的top肯定是不準的。
Pytracemalloc
對于基本類型,可以通過sys.getsizeof()來查看對象占用的內存大小。以下是在64位Linux下的一些結果:
>>> import sys >>> sys.getsizeof(1) 24 >>> sys.getsizeof([]) 72 >>> sys.getsizeof(()) 56 >>> sys.getsizeof({}) 280 >>> sys.getsizeof(True) 24
可以看到,即使是一個int類型(1)也需要占用24個字節,遠遠高于C語言中int的范圍。因為Python中一切都是對象,int也不例外(事實上是PyIntObject),除了真正存儲的數值,還需要保存引用計數信息、類型信息,更具體的可以參見《Python源碼剖析》。
而對于更復雜的組合類型,復雜的代碼,使用getsizeof來查看就不準確了,因為在Python中變量僅僅指向一個對象,這個時候就需要更高級的工具,比如 guppy , pysizer , pytracemalloc, objgraph 。在這里重點介紹pytracemalloc。
在Python3.4中,已經支持了pytracemalloc,如果使用python2.7版本,則需要對源碼打補丁,然后重新編譯。pytracemalloc在 pep454 中提出,主要有以下幾個特點:
- Traceback where an object was allocated
- Statistics on allocated memory blocks per filename and per line number: total size, number and average size of allocated memory blocks
- Compute the differences between two snapshots to detect memory leaks
簡單來說,pytracemalloc hook住了python申請和釋放內存的接口,從而能夠追蹤對象的分配和回收情況。對內存分配的統計數據可以精確到每個文件、每一行代碼,也可以按照調用棧做聚合分析。而且還支持快照(snapshot)功能,比較兩個快照之間的差異可以發現潛在的內存泄露。
下面通過一個例子來簡單介紹pytracemalloc的用法和接口,關于更詳細用法和API,可以參考這份詳盡的 文檔 或者pytracemalloc的作者在pycon上的 演講ppt 。
import tracemalloc NUM_OF_ATTR = 10 NUM_OF_INSTANCE = 100 class Slots(object): __slots__ = ['attr%s'%i for i in range(NUM_OF_ATTR)] def __init__(self): value_lst = (1.0, True, [], {}, ()) for i in range(NUM_OF_ATTR): setattr(self, 'attr%s'%i, value_lst[i % len(value_lst)]) class NoSlots(object): def __init__(self): value_lst = (1.0, True, [], {}, ()) for i in range(NUM_OF_ATTR): setattr(self, 'attr%s'%i, value_lst[i % len(value_lst)]) def generate_some_objs(): lst = [] for i in range(NUM_OF_INSTANCE): o = Slots() if i % 2 else NoSlots() lst.append(o) return lst if __name__ == '__main__': tracemalloc.start(3) t = generate_some_objs() snapshot = tracemalloc.take_snapshot() top_stats = snapshot.statistics('lineno') # lineno filename traceback print(tracemalloc.get_traced_memory()) for stat in top_stats[:10]: print(stat)
在上面的代碼中,用到了pytracemalloc幾個核心的API:
start(nframe: int=1)
pytracemalloc的一大好處就是可以隨時啟停,start函數即開始追蹤內存分配,相應的stop會停止追蹤。start函數有一個參數,nframes : 內存分配時記錄的棧的深度,這個值越大,pytracemalloc本身消耗的內存越多,在計算cumulative數據的時候有用。
get_traced_memory()
返回值是擁有兩個元素的tuple,第一個元素是當前分配的內存,第二個元素是自內存追蹤啟動以來的內存峰值。
take_snapshot()
返回當前內存分配快照,返回值是Snapshot對象,該對象可以按照單個文件、單行、單個調用棧統計內存分配情況
運行環境:windows 64位python3.4
(62280, 62920) test_pytracemalloc_use_py3.4.py:10: size=16.8 KiB, count=144, average=120 B test_pytracemalloc_use_py3.4.py:17: size=16.7 KiB, count=142, average=120 B test_pytracemalloc_use_py3.4.py:19: size=9952 B, count=100, average=100 B test_pytracemalloc_use_py3.4.py:26: size=9792 B, count=102, average=96 B test_pytracemalloc_use_py3.4.py:27: size=848 B, count=1, average=848 B test_pytracemalloc_use_py3.4.py:34: size=456 B, count=1, average=456 B test_pytracemalloc_use_py3.4.py:36: size=448 B, count=1, average=448 B D:\Python3.4\lib\tracemalloc.py:474: size=64 B, count=1, average=64 B
如果將第36行的“lineno“改成“filename”,那么結果如下
(62136, 62764) test_pytracemalloc_use_py3.4.py:0: size=54.5 KiB, count=491, average=114 B D:\Python3.4\lib\tracemalloc.py:0: size=64 B, count=1, average=64 B
有了Profile結果之后,可以看出來在哪個文件中有大量的內存分配。與性能優化相同,造成瓶頸的有兩種情況:單個對象占用了大量的內存;同時大量存在的小對象。對于前者,優化的手段并不多,惰性初始化屬性可能有一些幫助;而對于后者,當同樣類型的對象大量存在時,可以使用slots進行優化。
Slots
默認情況下,自定義的對象都使用dict來存儲屬性(通過obj.__dict__查看),而python中的dict大小一般比實際存儲的元素個數要大(以此降低hash沖突概率),因此會浪費一定的空間。在新式類中使用__slots__,就是告訴Python虛擬機,這種類型的對象只會用到這些屬性,因此虛擬機預留足夠的空間就行了,如果聲明了__slots__,那么對象就不會再有__dict__屬性。
使用slots到底能帶來多少內存優化呢,首先看看 這篇文章 ,對于一個只有三個屬性的Image類,使用__slots__之后內存從25.5G下降到16.2G,節省了9G的空間!
到底能省多少,取決于類自身有多少屬性、屬性的類型,以及同時存在多少個類的實例。下面通過一段簡單代碼測試一下:
# -*- coding: utf-8 -*- import sys import tracemalloc NUM_OF_ATTR = 3 #3 # 10 # 30 #90 NUM_OF_INSTANCE = 10 # 10 # 100 class Slots(object): __slots__ = ['attr%s'%i for i in range(NUM_OF_ATTR)] def __init__(self): value_lst = (1.0, True, [], {}, ()) for i in range(NUM_OF_ATTR): setattr(self, 'attr%s'%i, value_lst[i % len(value_lst)]) class NoSlots(object): def __init__(self): value_lst = (1.0, True, [], {}, ()) for i in range(NUM_OF_ATTR): setattr(self, 'attr%s'%i, value_lst[i % len(value_lst)]) if __name__ == '__main__': clz = Slots if len(sys.argv) > 1 else NoSlots tracemalloc.start() objs = [clz() for i in range(NUM_OF_INSTANCE)] print(tracemalloc.get_traced_memory()[0])
上面的代碼,主要是在每個實例的屬性數目、并發存在的實例數目兩個維度進行測試,并沒有測試不同的屬性類型。結果如下表:
百分比為內存優化百分比,計算公式為(b – a) / b, 其中b為沒有使用__slots__時分配的內存, a為使用了__slots__時分配的內存。
注意事項
關于__slots__,Python文檔有非常詳盡的介紹,這里只強調幾點注意事項
第一:基類和子類都必須__slots__,即使基類或者子類沒有屬性
>>> class Base(object): ... pass ... >>> class Derived(Base): ... __slots__ = ('a', ) ... >>> d.__slots__ ('a',) >>> getattr(d, '__dict__', 'No Dict') {}
從上面的示例可以看到,子類的對象還是有__dict__屬性,原因就在于基類沒有聲明__slots__。因此,可以通過看子類的實例有沒有__dict__屬性來判斷slots的使用是否正確
第二:子類會繼承基類的__slots__
更準確的說,如果訪問屬性的時候沒有在子類的__slots__找到,會繼續在基類的__slots__查找,因為Python使用descriptor在類這個層級實現__slots__的,具體可以參見《 python屬性查找 深入理解 》一文
>>> class Base(object): ... __slots__ = ('a',) ... >>> class Derived(Base): ... __slots__ = ('b', ) ... >>> d = Derived() >>> d.__slots__ ('b',) >>> getattr(d, '__dict__', 'No Dict') 'No Dict' >>> d.a = 1 >>> d.c = 0 Traceback (most recent call last): File "<stdin>", line 1, in <module> AttributeError: 'Derived' object has no attribute 'c'
objgraph
在大型工程中,怎么排查有哪些大量存在的對象呢,畢竟同一個類型存在的對象越多,優化越有效果。除了直接看代碼,最好使的就是使用objgraph.py的show_most_common_types(N)函數,該函數返回Python gc管理的所有對象中,數目前N多的對象,在排除掉python builtin對象之后,剩下的就是可優化的對象。比如在最上面的代碼中:在最后加上這么兩句:
import objgraph objgraph.show_most_common_types(25)
輸出如下:
再論Python dict
前面介紹slots的時候,就提到Python自定義的對象中通過dict來管理屬性。這種機制極大的提高了Python的靈活性 — 可以隨時給對象增加屬性,但是其實現機制也帶來了內存上的浪費。不管是python源碼,還是Python程序,都大量使用了dict,因此這部分內存浪費不容小視。
python中的dict使用的是散列表(類似C++中的std::unordered_map),當計算出的hash值沖突的時候,采用開放地址法解決沖突(另一種常見的沖突解決算法是鏈表法)。為了降低沖突概率,當裝填因子(實際存儲的元素與散列表長度的比值)超過2/3的時候就會對散列表進行擴容,因此散列表中一定會存在一些未使用的槽。
下面簡單看看PyDictObject的數據結構(python2.7.3 dictobject.h)
#define PyDict_MINSIZE 8 typedef struct { /* Cached hash code of me_key. Note that hash codes are C longs. * We have to use Py_ssize_t instead because dict_popitem() abuses * me_hash to hold a search finger. */ Py_ssize_t me_hash; PyObject *me_key; PyObject *me_value; } PyDictEntry; typedef struct _dictobject PyDictObject; struct _dictobject { PyObject_HEAD Py_ssize_t ma_fill; /* # Active + # Dummy */ Py_ssize_t ma_used; /* # Active */ /* The table contains ma_mask + 1 slots, and that's a power of 2. * We store the mask instead of the size because the mask is more * frequently needed. */ Py_ssize_t ma_mask; /* ma_table points to ma_smalltable for small tables, else to * additional malloc'ed memory. ma_table is never NULL! This rule * saves repeated runtime null-tests in the workhorse getitem and * setitem calls. */ PyDictEntry *ma_table; PyDictEntry *(*ma_lookup)(PyDictObject *mp, PyObject *key, long hash); PyDictEntry ma_smalltable[PyDict_MINSIZE]; };
從定義可以看出,除了固定的部分(幾個Py_ssize_t),PyDictObject中主要是PyDictEntry對象,PyDictEntrty包含一個Py_ssize_t(int)和兩個指針。上面源碼中的注釋(第26行)指出,當dict的元素比較少時,ma_table指向ma_smalltable,當元素增多時,ma_table會指向新申請的空間。ma_smalltable的作用在于Python(不管是源碼還是代碼)都大量使用dict,一般來說,存儲的元素也不會太多,因此Python就先開辟好PyDict_MINSIZE(默認為8)個空間。
為什么說PyDictObject存在浪費呢,PyDictEntry在32位下也有12個字節,那么即使在ma_smalltable(ma_table)中大量的位置沒有被使用時,也要占用這么多字節。用 這篇文章 中的例子:
假設有這么一個dict:
d = {'timmy': 'red', 'barry': 'green', 'guido': 'blue'}
在Python源碼中的視圖就是這樣的:
# 下面的entries就是ma_smalltable entries = [['--', '--', '--'], [-8522787127447073495, 'barry', 'green'], ['--', '--', '--'], ['--', '--', '--'], ['--', '--', '--'], [-9092791511155847987, 'timmy', 'red'], ['--', '--', '--'], [-6480567542315338377, 'guido', 'blue']]
然而,完全可以這么存儲:
indices = [None, 1, None, None, None, 0, None, 2] entries = [[-9092791511155847987, 'timmy', 'red'], [-8522787127447073495, 'barry', 'green'], [-6480567542315338377, 'guido', 'blue']]
indices的作用類似ma_smalltable,但只存儲一個數組的索引值,數組只存儲實際存在的元素(PyDictEntry),當dict中的元素越稀疏,相比上一種存儲方式使用的內存越少。而且,這種實現, dict就是有序的(按插入時間排序)
這就是python3.6中新的dict實現,Compact dict! Stackoverflow上也有相關 討論 。
總結
本文中介紹了Python內存優化的Profile工具,最有效的優化方法:使用slots,也介紹了在python3.6中新的dict實現。
當然,還有一些良好的編碼習慣。比如盡量使用immutable而不是mutable對象:使用tuple而不是list,使用frozenset而不是set;另外,就是盡量使用迭代器,比如python2.7中,使用xrange而不是range,dict的iterxx版本。
來自: http://python.jobbole.com/88896/